| 名称 | 河口の 都道府県名 |
流域面積（km2） | 長さ（km） |
| 利根川（とねがわ） | 茨城・千葉 | 16,840 | 322 |
| 石狩川（いしかりがわ） | 北海道 | 14,330 | 268 |
| 信濃川（しなのがわ） | 新潟 | 11,900 | 367 |
| 北上川（きたかみがわ） | 宮城 | 10,150 | 249 |
| 木曽川（きそがわ） | 三重・愛知 | 9,100 | 227 |
| 十勝川（とかちがわ） | 北海道 | 9,010 | 156 |
| 淀川（よどがわ） | 大阪 | 8,240 | 75 |
| 阿賀野川（あがのがわ） | 新潟 | 7,710 | 210 |
| 最上川（もがみがわ） | 山形 | 7,040 | 229 |
| 天塩川（てしおがわ） | 北海道 | 5,590 | 256 |
| 阿武隈川（あぶくまがわ） | 宮城 | 5,400 | 239 |
| 天竜川（てんりゅうがわ） | 静岡 | 5,090 | 213 |
| 雄物川（おものがわ） | 秋田 | 4,710 | 133 |
| 米代川（よねしろがわ） | 秋田 | 4,100 | 136 |
| 富士川（ふじがわ） | 静岡 | 3,990 | 128 |
| 江の川（ごうのかわ） | 島根 | 3,870 | 194 |
| 吉野川（よしのがわ） | 徳島 | 3,750 | 194 |
| 那珂川（なかがわ） | 茨城 | 3,270 | 150 |
| 荒川（あらかわ） | 東京 | 2,940 | 169 |
| 九頭竜川（くずりゅうがわ） | 福井 | 2,930 | 116 |
| 筑後川（ちくごがわ） | 福岡 | 2,860 | 143 |
| 神通川（じんつうがわ） | 富山 | 2,720 | 120 |
| 高梁川（たかはしがわ） | 岡山 | 2,670 | 111 |
| 岩木川（いわきがわ） | 青森 | 2,540 | 102 |
| 釧路川（くしろがわ） | 北海道 | 2,510 | 154 |
| 熊野川（くまのがわ） | 三重・和歌山 | 2,360 | 183 |
| 四万十川（しまんとがわ） | 高知 | 2,270 | 196 |
| 大淀川（おおよどがわ） | 宮崎 | 2,230 | 107 |
| 斐伊川（ひいかわ） | 島根 | 2,070 | 153 |
| 吉井川（よしいがわ） | 岡山 | 2,060 | 133 |
| 馬渕川（まべちがわ） | 青森 | 2,050 | 142 |